Місце розрізу ферменту рестрикції: C/TCGAG.
У молекулярній біології XhoI є ензимом рестрикції типу II EC, який розпізнає послідовність дволанцюгової ДНК CTCGAG і розщеплюється після C-1. Рестрикційні ендонуклеази (ЕС) типу II є компонентами механізмів рестрикції-модифікації прокаріотичної ДНК, які захищають організм від вторгнення чужорідної ДНК.
Сайт обмежень є послідовність із приблизно 6–8 пар основ ДНК, яка зв’язується з даним рестриктазою. Ці ферменти рестрикції, яких є багато, були виділені з бактерій. Їхня природна функція полягає в тому, щоб інактивувати проникаючі віруси шляхом розщеплення вірусної ДНК.
Рекомендований протокол травлення додати: вода без нуклеази 16 мкл 10X Buffer R 2 мкл ДНК (0,5-1 мкг/мкл) 1 мкл XhoI 0,5-2 мкл* • Обережно перемішайте та обертайте кілька секунд. Інкубуйте при 37°C протягом 1-16 годин. Реакція травлення може бути збільшена або зменшена.
Активність XhoI порушується метилюванням CpG (CG метилаза дуже повільно розщеплює CT5mCGAG). Використовуються ферменти рестрикції розпізнати певну послідовність нуклеотидів і розрізати дволанцюгову ДНК на менші фрагменти в певному місці. Кожен фермент рестрикції розпізнає різні послідовності ДНК.
Щоб знайти та анотувати сайти рестрикції в послідовності нуклеотидів, перейдіть до «Знайти сайти обмежень»… у меню «Інструменти» → «Клонування» або відкрийте вкладку «Аналіз обмежень» праворуч від засобу перегляду послідовностей.