Недоліки використання маркерів у селекції рослин Вартість розробки молекулярних маркерів може бути високою. Ця вартість включає розробку молекулярних зондів, вартість обладнання та матеріалів, а також вартість персоналу, необхідного для розробки маркерів.11 квітня 2023 р.
Селекція за допомогою маркерів на культурах може мати такі недоліки, як потенційні наслідки вартості, обмежена доступність маркерів і проблеми з перенесенням ознак від диких джерел до елітних сортів. Відбір за допомогою маркерів може стати непрактичним, оскільки кількість алелів QTL збільшується, що обмежує його ефективність.
Основними недоліками є низький рівень поліморфізму та домінантний спосіб успадкування, що менш підходить для MAS. Слід зазначити, що маркери AFLP застосовуються для виявлення метилювання ДНК за допомогою пар рестриктаз (чутливих до метилювання та стійких до метилювання).
Недоліками цього підходу є: 1. втрата селективного тиску в результаті деградації та інактивації антибіотиків. 2. забруднення продукту або біомаси антибіотиками, що може бути неприйнятним з медичних або нормативних міркувань.
Фундаментальні переваги MAS порівняно зі звичайним фенотиповим відбором:
- Простіший порівняно з фенотиповим скринінгом.
- Відбір можна проводити на розсадному етапі.
- Поодинокі рослини можна вибрати з високою надійністю.
Ризики селекційного розведення включають:
- зменшення генетичної варіації може призвести до нападу певних комах або хвороб, які можуть бути надзвичайно руйнівними.
- гени рідкісних захворювань можуть бути несвідомо обрані як частина позитивної ознаки, що призводить до проблем із певними організмами, наприклад, високий відсоток далматинських собак є глухими.