є більш точним для дуже схожих нуклеотидних послідовностей. tblastx більш чутливий до розбіжних послідовностей. Дійсно, він може краще виявляти подібність між віддалено спорідненими послідовностями, ніж blastn.
Таким чином, tBLASTn дуже корисний для пошук гомолога(ів) білка в неанотованих нуклеотидних даних такі як виражені мітки послідовності (зберігаються в базі даних BLAST «est») і проекти записів генома (розташовані в базі даних BLAST «htgs»), які залишаються без анотацій у відповідних базах даних.
TBLASTN є режим роботи для BLAST, який вирівнює послідовності білків до бази даних нуклеотидів, трансльованих у всіх шести кадрах.
Поширеним використанням програм «tblastn» і «blastx» є щоб допомогти анотувати кодуючі області на послідовності нуклеотидів; вони також корисні для виявлення кадрових зсувів у цих областях кодування.
BLASTX – Програма шукає в базах даних білків за допомогою запиту на трансльовані нуклеотиди. BLASTN – Програма шукає в базах даних нуклеотидних послідовностей за допомогою послідовності нуклеотидних запитів. BLASTP – Програма шукає в базах даних послідовностей білків за допомогою послідовності запитів білка.
Blastx шукатиме вашу послідовність у базі даних білків із послідовністю нуклеотидів як вхідних даних, а tblastn шукатиме в базі даних нуклеотидів із введенням білків.